La population canadienne d'Engoulevent bois-pourri est mieux surveillée par le Relevé des oiseaux nicheurs (BBS). Bien que le BBS ne soit pas bien adapté à la détection d'une espèce essentiellement nocturne, il échantillonne une grande partie de la répartition de la population nicheuse canadienne et ses tendances sont d'une précision élevée. L'inventaire canadien sur les engoulevents permet une surveillance plus ciblée de la population, mais il n'est pas encore opérationnel depuis assez longtemps pour donner des indications significatives sur les tendances. La tendance nationale du BBS montre une baisse constante depuis le début des années 1980 jusqu'en 2005 environ, puis une stabilisation et, ces dernières années, une modeste remontée à un niveau inférieur d'un peu plus de 25 % à celui du début des années 1970. La baisse a été un peu plus précoce et plus marquée dans le sud de l'Ontario et du Québec que dans la partie nord de l'aire de répartition canadienne. Les Atlas des oiseaux nicheurs de l'Ontario et du Québec indiquent également des baisses.

L'objectif pour l'Engoulevent bois-pourri est d'augmenter la population jusqu'à son niveau du début des années 1970, d'après le Relevé des oiseaux nicheurs. Les tendances montrent que l'Engoulevent bois-pourri est actuellement en dessous de son objectif, mais que sa population a connu une hausse au cours de la dernière décennie. L'analyse des tendances récentes et des taux de croissance potentiels suggère que l'Engoulevent bois-pourri pourrait atteindre son objectif de population d'ici 2050 avec le soutien des mesures de conservation. Cet objectif est plus ambitieux que ceux du programme de rétablissement de l'Engoulevent bois-pourri en vertu de la Loi sur les espèces en péril, qui prévoit de limiter la baisse entre 2018 et 2028 à un maximum de 10 %, puis d'assurer une tendance positive après 2028, avec la recolonisation des aires précédemment occupées dans la partie sud de sa répartition au Canada (Environnement Canada, 2015).