Le Relevé des oiseaux nicheurs (BBS) est la meilleure source d'information sur l'état de la population de Cormorans à aigrettes au Canada. Bien qu'il échantillonne mal les habitats côtiers, il assure une bonne couverture de la Région de conservation des oiseaux (RCO) des Marmites torrentielles des Prairies, qui abrite une grande partie de la population. En général, la couverture spatiale est élevée et la précision des estimations l'est également. Le BBS indique une augmentation importante de la population par rapport à 1970, de l'ordre de plus de 500 %. Parmi les régions où la précision des tendances est au moins jugée moyenne ou élevée, l'augmentation a été la plus forte dans le sud des Grands Lacs et la plus modeste dans les Maritimes. La seule région présentant une légère diminution à long terme est la côte Pacifique, mais la précision de cette tendance est faible. La tendance du Recensement des oiseaux de Noël à l'échelle continentale montre également une augmentation importante, de près de 2000 % depuis 1970.

L'objectif pour la population de Cormoran à aigrettes est de rester à un niveau similaire ou supérieur à sa population récente, d'après le Relevé des oiseaux nicheurs. Bien que la croissance de la population suscite des inquiétudes localisées et que la chasse soit autorisée dans plusieurs provinces, il n'est pas nécessaire, à ce stade, de fixer un plafond général à la croissance de la population. Les tendances montrent que le Cormoran à aigrettes se trouve actuellement dans sa zone d'objectif.